Výzkum založený na pacientech shledává stopy genetických kořenů vzácné rakoviny

0 17

rakovina
Killer T buňky obklopují rakovinnou buňku. Kredit: NIH

V úzké spolupráci s pacienty vědci z Broad Institute of MIT and Harvard, Dana-Farber Cancer Institute a Count Me In identifikovali nové příčiny vzácné rakoviny stěn krevních cév zvané angiosarkom. Výzkum také poukazuje na možné terapeutické možnosti pro pacienty s tímto agresivním onemocněním, kteří mají často špatnou prognózu.

Studie je výsledkem projektu Angiosarcoma, jedinečného partnerství mezi nimi a vědci, kteří umožňují pacientům přispívat svými lékařskými záznamy, biologickými vzorky a hlasy k urychlení výzkumu. Práce také ukazuje, jak úsilí založené na davu, které sjednocuje malou a rozptýlenou skupinu pacientů, může přinést neočekávaná zjištění o nemoci, kterou bylo obtížné studovat, protože je tak vzácná.

Ve studii zveřejněné v Nature Medicinevědci analyzovali genomy téměř 50 nádorových vzorků darovaných pacienty s angiosarkomem z USA a Kanady. Tým našel desítky mutovaných genů v různých formách rakoviny, jakož i stopy naznačující, že léky schválené pro jiné typy rakoviny mohou být užitečné při léčbě některých druhů angiosarkomu.

„Tato práce byla možná pouze s našimi pacientskými partnery,“ řekl vedoucí autor Nikhil Wagle, člen institutu Broad, lékařský onkolog v Dana-Farber, docent na Harvardské lékařské fakultě a ředitel Count Me In. vědecké poznatky, které pomohly vytvořit, vrhly nové světlo na špatně pochopené kořeny angiosarkomu, který naléhavě potřebuje nové možnosti léčby pro pacienty. "

„Když jsme data poprvé viděli, byli jsme nadšeni, když jsme zjistili, že tyto objevy byly patrné z genomických dat od samého začátku,“ řekla spoluautorka Corrie Painter, docentka a provozní ředitelka programu Broad Cancer Program a spolupracovník ředitele Count Me In. „Práce s pacienty na návrhu a vybudování projektu od začátku byla fenomenální zkušenost. Painter, vědkyně, se stala pacientkou obhájkyní po její diagnóze angiosarkomu v roce 2010.

Partnerství pacientů

Projekt Angiosarcoma zahájený v roce 2017 a je součástí programu Count Me In, který si klade za cíl katalyzovat výzkum několika typů rakoviny přímým zapojením onkologických pacientů online do biomedicínských studií bez ohledu na to, kde žijí ve Spojených státech nebo Kanadě. Hrabě Me In byl postaven na úspěchu počátečního úsilí, projektu Metastatic Cancer Cancer (MBC), který také vyústil v četné objevy. Cílem projektu Angiosarcoma bylo zhodnotit tento model partnerství s pacienty v souvislosti se vzácným onemocněním, kde je pro zlepšení výsledků pacientů nezbytně zapotřebí výzkumu.

Angiosarkom vzniká v endoteliálních buňkách, které tvoří vnitřní obložení krevních cév a mohou se vyskytovat kdekoli v těle, ale nejčastěji se vyskytují v kůži, prsu, játrech a slezině. Je to mimořádně vzácná rakovina, ve Spojených státech je každý rok pouze 300 nových případů a prognóza je obecně špatná. Pacienti jsou rozptýleni po celé zemi, takže rozsáhlé studie zaměřené na nalezení molekulárních podkladů nemoci nebyly dosud proveditelné.

Tým ASCproject vytvořil pracovní skupinu pro sociální média, která spojuje pacienty s angiosarkomem a milovanými online a vyzývá je, aby pomohli utvářet informační strategii projektu. Na základě zpětné vazby od partnerů pacientů vytvořil tým online portál na ascproject.org, který umožňuje pacientům v USA a Kanadě připojit se ke studii a přispět k jejich anamnéze a vzorkům nádorů nebo krve pro testování DNA. Do 18 měsíců od zahájení projektu ASCprojekt se zaregistrovalo 338 pacientů, velká část všech pacientů v USA s angiosarkomem.

Projektový personál získal se souhlasem pacienta lékařské záznamy a vzorky nádorů z podskupiny registrovaných pacientů. Platforma Broad's Genomics Platform sekvenovala exom, nebo protein kódující oblasti, 47 těchto vzorků nádorů spolu s zárodečnou (zděděnou) DNA od stejných pacientů. Spoluautor Esha Jain, výpočetní biolog v laboratoři Wagle, vedl analýzu dat, která odhalila 30 genů, které byly často mutovány v několika nádorech. Některé z těchto genů nebyly nikdy spojeny s angiosarkomem, jako je PIK3CA, GRIN2A a NOTCH2.

Možné možnosti léčby

Většina vzorků s mutacemi v PIK3CA byla v případech angiosarkomu prsu. Vědci se podívali na to, kde mutace spadly do samotného genu, a usoudily, že pravděpodobně budou „aktivačními“ mutacemi, což znamená, že dají proteinu novou nebo vylepšenou funkci. To naznačuje, že blokování dráhy PIK3CA lékem schváleným FDA známým jako inhibitor PI3 kinázy by mohlo být užitečné pro pacienty s angiosarkomy prsu, kteří nesou jednu z těchto mutací.

Gen PIK3CA je také mutován v adenokarcinomu prsu, což je jiný typ rakoviny, ke kterému dochází ve stejné tkáni, což naznačuje, že něco o buněčném prostředí prsu podporuje tyto nádory k rozvoji.

"Taková zjištění mohou skutečně otevřít dveře, pokud jde o to, jak přemýšlíme o genech v tkáňově specifických kontextech pro rakovinovou tumorigenezi," řekl Painter. „Bez těchto údajů bychom nikdy neměli takovou vhled. "

Tým změřil celkovou míru mutace nádorů a zjistil, že angiosarkomy hlavy, krku, obličeje a pokožky hlavy (HNFS) mají vyšší zátěž mutací než ostatní. Vzorec těchto mutací byl dříve spojen s poškozením ultrafialovým zářením, což naznačuje, že poškození Slunce mohlo u těchto pacientů vést k onemocnění.

Protože jiné nádory s nadměrnými mutacemi reagovaly na léčbu léky známými jako inhibitory imunitního bodu (ICI), vědci předpokládali, že tyto léky mohou pomoci pacientům s HNFS. Ve skutečnosti našli dva pacienty ve studii s angioarkomem HNFS, kteří poté, co neodpověděli na standardní léčbu, dostali ICI mimo značku a na léčbu reagovali mimořádně dobře. I když je třeba kvůli vedlejším účinkům léčbu přerušit, tito pacienti dnes zůstávají bez onemocnění bez dalšího léčení rakoviny. To naznačuje, že ICI mohou potenciálně pomoci některým pacientům s tímto podtypem.

Rostoucí dopad

Je zapotřebí více práce, aby se prokázalo, zda jsou tyto nestandardní léčby účinné pro pacienty, ale tato zjištění posílila výzkum angiosarkomu. Probíhají nejméně tři klinické studie, které nyní zahrnují pacienty s angiosarkomem kvůli údajům v této studii, která byla před zveřejněním sdílena s vědeckou a lékařskou komunitou.

Projekt ASCproject pokračuje v zaznamenávání pacientů a analýze dat a nyní dosáhl téměř 500 registrovaných pacientů. "Byl to cíl, který jsem upřímně nevěděl, jestli bychom někdy dosáhli, natož dosáhnout za dva a půl roku," řekl Painter.

Jim Chapdelaine, kytarista a hudebník, který získal cenu Emmy v Hartfordu v Connecticutu, byl poprvé diagnostikován angiosarkomem v roce 1976. Do studie se zapojil v naději, že jeho zkušenost s pozůstalým pozůstalým může pomoci dalším pacientům. "Je to úžasné vědět, že já a ostatní v komunitě pacientů jsme pomohli podpořit tyto nové objevy," řekl. „Doufám, že jednoho dne vyléčím, ale tato studie pomůže otevřít vědecké dveře a doufáme, že lidé jimi nyní projdou. "

Painter vysvětlil, že nová zjištění jsou nadějná, ale také hořká, jak si pamatuje přátele komunita, která nemoc nepřežila. "Účastníci projektu ASCproject se přihlásili v naději, že to pomůže lidem na cestě," řekla. "Jsme vděční za to, že uprostřed své vlastní diagnózy chtěli udělat svou část, aby pomohli zabránit utrpení jiných pacientů." "


Imunoterapie s identifikací genomiky s partnerskými pacienty jako potenciální léčba vzácné rakoviny


Více informací:
Projekt Angiosarcoma: umožňuje genomické a klinické objevy u vzácné rakoviny prostřednictvím výzkumu prováděného pacientem, Nature Medicine (2020). DOI: 10.1038 / s41591-019-0749-z , https://nature.com/articles/s41591-019-0749-z

Citace:
Výzkum založený na pacientech shledává stopy genetických kořenů vzácné rakoviny (2020, 10. února)
načteno 10. února 2020
z https://medicalxpress.com/news/2020-02-patient-partnered-clues-rare-cancer-genetic.html

Tento dokument podléhá autorskému právu. Kromě jakéhokoli spravedlivého jednání za účelem soukromého studia nebo výzkumu, ne
část může být reprodukována bez písemného souhlasu. Obsah je poskytován pouze pro informační účely.

Tento článek se objevil jako první https://medicalxpress.com/news/2020-02-patient-partnered-clues-rare-cancer-genetic.html

Zanechat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.